崇禎四年五月三十一日，朱由檢率其主力返回京師，連夜逃竄。在逃離北京之前，明軍大肆劫掠城內衙門和官員宅邸，爲了不讓京師落在齊賊手中，爲了證明自己是真正的天下之主，穿越者下令將他曾擁有的都城摧毀。
六月一日，朱由檢下令在京城四處放火，命令宣府、大同邊軍殿後，然後親率一萬京營戰兵、心腹大臣（不願南遷的大臣已被處死）、宮女太監、數萬名新近招募的壯丁、以及數千輛金銀珠寶糧食物資，倉皇南狩。
當然，對外宣稱是遷都南京。
後來歷史學家在探討這段歷史時，總是扼腕嘆息，很多人都拍着大腿，不無憤恨說，如果當年在靖難之役中，崇禎皇帝能在北京堅守，帶領他的精銳戰兵與靖難軍血戰到底，儘量拖住敵軍，等九邊精銳圍攏上來，勝負未可知也。
無論如何，穿越者帶着他一手打造的精銳強軍、帶着後宮嬪妃，帶着滿腔失望憤恨，南遷了。
這就給了京師百姓向落在後面的明軍錦衣衛報復的機會，隨着越來越多靖難軍出現在城郊，京城百姓的膽子越來越大了，他們開始成羣結隊的搜捕掉隊的京營士兵，他們把錦衣衛扔到熊熊大火中，笑着跳着看這些朝廷鷹犬化爲火球。那些在山海關大戰中受傷的不能南下的京營士兵，則被百姓們砍下腦袋，作爲投名狀來迎接這座城池的新一任徵服者。
“民心可用！應讓大軍立即進城。”一名潛伏京城的情報人員這樣向特務頭子張潮彙報。
見慣了大世面的京城百姓對改朝換代並不陌生，甚至有好事者已經準備向大元帥進獻賀表，擁護這位武人稱帝。
聽聞靖難軍旌旗皆爲紅色，北京城家家戶戶都把門前掛上了紅布條。
百姓們緊張地等待着大元帥入城，那些曾在崇禎朝呼風喚雨如今因爲各種原因沒能逃走的人，則戰戰兢兢，默默等待吳三桂和齊孟對他們的懲罰。
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入京和入關一樣，都充滿不確定性。
站在齊孟的角度上來看，崇禎四年的北京城，無疑是個巨大的負擔，一百萬人的衣食全部仰仗運河供給，連百姓取暖生火用的煤，也要從山西河北等地運來······
“大帥，朱由檢逃了，說是要去江南打獵。”
大元帥的行轅到了永定門，前鋒騎兵已經開始接手這座城池，而齊孟卻猶豫不決，遲遲不肯進城。
張潮從城中找到幾張墨跡未乾的告示，這才知道朱由檢昨晚便已逃走。
齊孟接過告示，瞟了一眼，把紙揉成一團扔到了護城河裏。
“他應該在煤山的歪脖子樹上，上吊殉國，沒想到卻逃了。”
他不是一個合格的穿越者。
齊孟想了會兒，抬頭望着城中四處燃起的黑煙，劍眉緊蹙。
“這狗賊搶完東西放把火跑了，把這個爛攤子交給本官，委實可惡！”
張潮連忙道：“大帥，鄧長雄、蒲剛已經派人去追了。”
齊孟聽了沒有說話，只是盯着永定門上的牌匾，沉默良久，他當然沒指望這麼容易就殺死朱由檢。
話說回來，做人留一線，日後好相見，同爲穿越者，只要朱由檢能認識到他們的共同敵人是藤蔓公司，而不是彼此，齊孟還是會給他活路的。——雖然目前看來做到這點很難。
身披紅色鎧甲、背插紅色小旗的馬兵不斷從身邊掠過，城中響起一陣噼裏啪啦，張潮大喫一驚，下意識就要拔刀，齊孟若無其事道：
“是京師百姓在喜迎王師。”
話剛落音，城內便響起喧鬧的鑼鼓聲。
張潮尷尬一笑：“大帥，該進城了。”
齊孟在衛兵的護衛下，緩緩走下馬車，四周頓時傳來振聾發聵的萬勝聲。
在總訓導官森悌的鼓動下，上萬名戰兵齊聲高呼：
“萬勝！”
“萬勝！”
齊孟翻身上馬，舉手向周圍示意，人羣爆發出更強烈的吶喊，萬勝之聲直入雲霄。
齊孟朝身後望了一眼，數萬將士紛紛朝他目光看去，衆目睽睽之下，六歲的皇子朱慈淼身披龍袍，在十六名錦衣衛大漢將軍的簇擁着，緩緩走到大元帥身前。
齊孟連忙迎上前去，面朝朱慈淼單膝下跪，口中大聲道：“殿下恕罪，末將鎧甲不便，僅以軍禮見！”
距離朱慈淼最近的一名大漢將軍在皇子身前耳語幾句，朱慈淼揮動龍袍袖口，說出一口濃郁的四川話：
“遼陽伯快快請起，你與衆將士披堅執銳，爲父皇報仇雪恨，殺了朱由檢這奸賊，爲社稷除此大害，朝廷應當重賞你們！”
大漢將軍又在朱慈淼耳邊提示幾句，小皇子接着道：
“封遼陽伯爲遼王，贊拜不名、入朝不趨、劍履上殿·····”
朱慈淼代表朝廷，宣讀了一大段名字，其中包括參與靖難之役的主要將領以及吳三桂部將，對其加官進爵不在話下，好不容易讀完，周圍將士卻是鴉雀無聲，齊孟環顧四周，大聲道：“還不向殿下謝恩！”
數萬將士齊刷刷跪下，一起高呼：“謝殿下洪恩！”
“諸位將士們請起！”
戰兵們仍舊紋絲不動。
直到齊孟揮了揮手，低聲道：“都起來吧！”各營軍官這才揮舞令旗，指揮底下戰兵起身。
大漢將軍護送皇子緩緩進入北京城，年幼的朱慈淼睜大眼睛，一臉茫然的望着周圍密密麻麻的戰兵，最後回頭看了眼不怒自威咄咄逼人的遼王齊孟。
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六月一日午時，在大明禁衛軍的護衛下，齊孟攙扶朱慈淼，緩緩地登上了餘盡未熄的武英殿。
此時武英殿中早已擠滿了前來投靠的崇禎舊臣，城中大小京官五六千人，一部分被朱由檢帶走，一部分死於亂兵之中，倖存下來渴望效命大元帥的，至少還有三千人。
齊孟領着皇子走過文武百官身前，百官們長跪不起，一個個把屁股撅得老高。
進殿之後，齊孟俯視羣臣，俯身對朱慈淼和顏悅色道：
“當務之急，陛下須儘快登基，繼承大統，爲此，須讓他們推選出瞭解登基禮儀的官員。”
朱慈淼點頭道：“我不懂這些，都聽遼王定奪。”
齊孟推辭再三，最終還是接過了這個輔左皇子登基的重任。
他望向翰林院編修李明睿，彬彬有禮請他出任新任禮部左侍郎，組織禮部官員籌劃新皇登基事宜。
李明睿以頭搶地，痛哭流涕道：“臣年老體弱，恐不能勝任。”
齊孟大怒，指着李明睿鼻子罵道：“朱由檢弒兄竊國，本帥領兵百萬，現在好不容易將他擊敗了，先皇在天之靈，在看着你們啊，皇子下月便要繼位，你們這羣清流，卻在這裏推三阻四，該當何罪！”
李明睿誠惶誠恐，連忙磕頭接受了這一任命。